癌症基因 可分为两类：第一类是突变或缺失的基因；而二类基因在DNA层次上没有改变，而是通过表达变化影响表型。

常规上，在诸如癌症的疾病的研究中，仅突变（第一类）基因被认为是候选癌症基因，第二类癌症基因被癌症遗传学家所忽略。到目前为止，焦点还是一直集中在第一类类基因上，筛选方法主要限于寻找DNA的改变。

但是癌症表型是由基因表达的改变（第二类）引起的，并且突变基因与癌症表型之间没有简单的1：1关系。因此，仅知道一个基因是突变还是正常是不够的，知道该基因是否表达以及如何表达也很重要。

可以在一项测试中鉴定出表达过高和表达不足的基因，从而有可能识别在发育、癌变或其他任何研究过程中发生表达变化的基因。